TP-DB是从PDB中提取万个螺旋结构并编译而成的一个治疗肽设计数据库，允许查询化合物复合物模式以促进识别螺旋结构的序列基序。
背景介绍
蛋白质的二级结构赋予了其一种特殊的机械性能，特别是α-螺旋，可以介导各种类型的分子功能，包括细胞膜穿透、亚细胞定位、分子内/分子间变构，特殊螺旋DNA框架、以及蛋白质-蛋白质相互作用等。
功能肽的系统设计具有良好的治疗应用前景。现有的数据库如蛋白质二级结构数据库(PSS)不再服务于社区，而蛋白质二级结构字典(DSSP)则在提供蛋白质三级结构时才对二级结构进行注释。因此，作者从PDB中提取了约万个螺旋，并将其编译成一个数据库(治疗肽设计数据库：TP-DB)。本文展示了该数据库的三个应用：识别已知的纯化标签特异性抗体、设计一种新的抗菌肽（AMP），以及提示螺旋肽阻滞剂的点突变。
TP-DB链接
