Hi,大家好。对于做科研的小伙伴来说,不管做生信还是实验,经常需要构建进化树,很多人应该都会选择MEGA(MolecularEvolutionaryGeneticAnalysis)这款软件。MEGA这款软件的目标是从进化的角度出发,为探索、发现和分析DNA和蛋白质序列提供工具。从年第一个版本问世到今天为止,MEGA已经更新了8个版本,目前最新的版本为MEGAX。
今天我们就来介绍一下MEGAX在图形界面(GUI)下如何构建系统发育树。系统发育树又称演化树或者进化树,是一种呈现不同物种或者是同物种不同族群的个体之间的亲缘关系树状图,可应用于亲缘分支分类方法、流行病学以及生态学等等[1]。
第一步:下载MEGA软件
MEGA支持包括Windows,MacOS和LINUX多系统运行,可以说非常友好了。这里我下载的是macOS版本。
MEGA的网址(