论文剖析
生物信息学
ssi-ddi:使用化学子结构相互作用预测药物相互作用
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0.摘要
不同药物共同使用的一个主要问题是，会发生不良药物-药物相互作用(adversedrug-druginteraction,ddi)，这可能对机体造成严重伤害。虽然已经提出了几种计算方法来识别潜在的不良ddi，但仍有改进的空间。现有的方法并没有明确地基于ddi根本是由化学亚结构相互作用而不是整个药物的化学结构所引起的认识。此外，现有的方法大多依赖于手工设计的分子表示，这受到了领域专家知识的限制。我们提出了一种深度学习框架——子结构-子结构-药物-药物相互作用(ssi-ddi)，该框架直接操作于药物的原始分子图表示，以获得更丰富的特征提取;最重要的是，它将两种药物之间的DDI预测任务分解为识别它们各自亚结构之间的相互作用。SSI-DDI基于真实数据进行评估，与最先进的方法相比，它提高了DDI预测性能。源代码可以在